Probiotika werden definiert als "lebende Mikroorganismen, die in ausreichender Menge in aktiver Form in den Darm gelangen und hierbei positive gesundheitliche Wirkungen erzielen" (nach dem Bundesinstitut für gesundheitlichen Verbraucherschutz und Veterinärmedizin). Probiotische Mikroorganismen sind zum Beispiel spezielle Arten von Milchsäurebakterien der Gattung Lactobacillus und Bifidobacterium, die gegen Säuren recht widerstandsfähig sind und deshalb die Magen-Darmpassage überleben können.
Im Unterschied dazu sind Präbiotika spezifische unverdauliche Stoffe, die das Wachstum dieser Milchsäurebakterien in der Darmflora fördern und so die Abwehrfunktionen des Darmes und die Stoffwechselaktivität im Darmlumen möglicherweise verbessern können. Dazu gehören etwa Inulin, Oligofruktose, Galakto- und Soja-Oligosaccharide.
Nach neuen Erkenntnissen haben Pro- und Präbiotika einen synergistischen Effekt und stärken die Immunmodulation im Darm.
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